Pada umumnya whey protein diperoleh dari cairan susu sapi yang dipisahkan ketika proses pembentukan yougurt dan keju. Lalu di filtrasi untuk mendapatkan olahan dengan kadar protein tertentu.

Whey protein yang berhenti pada tahapan inilah yang disebut dengan whey protein concentrate.

Sedangkan Whey Protein Isolate diperoleh dengan menyaring whey protein concentrate kembali lebih dari satu kali dengan cara di difilter lagi sehingga didapatkan kadar protein yang lebih tinggi serta kadar lemak dan karbohidrat yang lebih rendah. Hal ini telah dibuktikan oleh penelitian yang dilakukan oleh jurnal penelitian US National Library of Medicine National Institutes of Health.(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3905294/)

Karena difilter lebih banyak maka partikel Whey Protein Isolate juga lebih halus dibanding whey protein concentrate sehingga proteinnya lebih mudah diserap oleh tubuh.